Els beneficis per a la salut dels probiòtics no només estan relacionats amb les soques utilitzades, sinó que també estan estretament relacionats amb la dosi. La investigació científica demostra que els probiòtics només poden colonitzar, multiplicar-se i exercir efectes reguladors a l'intestí quan es consumeixen en quantitats suficients. Això els permet millorar la microbiota intestinal, promoure la digestió i l'absorció de nutrients o millorar la immunitat. Tanmateix, la dosi efectiva varia segons la soca. Per exemple, algunes soques poden produir efectes positius amb una ingesta diària d'uns pocs centenars de milions de cèl·lules vives, mentre que altres requereixen quantitats més altes per aconseguir beneficis notables.
Per a la mateixa soca, dins d'un determinat rang, una dosi més alta és generalment més probable que produeixi beneficis significatius per a la salut que una dosi més baixa. Tanmateix, això no vol dir que "més sempre és millor". Excedir la dosi recomanada no augmentarà contínuament l'efecte i fins i tot pot provocar malbaratament o, en alguns casos, augmentar el risc de molèsties gastrointestinals.
A més, com que diferents soques tenen característiques i mecanismes d'acció diferents, simplement comparar el nombre de cèl·lules vives d'un producte no indica la seva eficàcia global. Una manera més científica d'avaluar l'eficàcia dels probiòtics és fer referència a l'evidència clínica que recolza la soca específica, en lloc de només la quantitat. A l'hora de triar productes, els consumidors haurien de centrar-se en les soques amb dades d'investigació clínica i certificació autoritzada, seleccionant aquelles que s'adaptin a les seves necessitats individuals en lloc de buscar cegament dosis altes o un gran nombre de bacteris vius.